Фамилия Михалко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Михаил.
После 988 г. каждый славянин во время официальной церемонии крещения получал от священника крестильное имя. Такое именование позволяло решать проблему идентификации: выделения конкретного человека из общества. Поэтому именно церковные имена и стали активной базой для создания фамилий.
Имя Михаил в переводе с древнееврейского означает «благонравный». Оно было довольно распространённым на Руси, поэтому у него существует множество производных форм: Миха, Миша, Михайло, Михаля, Михалко. Последняя из них и послужила основой для фамилии Михалко.